com маппинг

Цитата
... мапиться сканер к терминалу по com порту

Уточните, что вы под этим понимаете? Если я не ошибаюсь, маппинг портов происходит между сервером и терминалом.

После установки, АРМ кассира начинает работать с COM-портами (использовать их под разное оборудование) только после того, как администратор сознательно их задействует в настройке программы. Самостоятельно АРМ кассира никакие порты без спроса не открывает и не блокирует.