В 100-ке с ФФД 1.05 при работе с базой, и с товарами со свободной ценой, отдел берется из самой базы. Кассиры, видимо, по привычке нажимают клавишу 1-го отдела и касса переходит на 5-ый, а у Вас там другой налог и другая СНО. Попросите кассиров не нажимать клавишу отдела при работе с базой или сделайте 5-ый отдел таким же как и первый.
Действительно, если выбрать через фц товар а после выбрать тот же отдел к которому привязан товар то получается как будто 2 раза по кнопке отдела нажимают, спасибо большое за оперативное решение вопроса, вы очень помогли.