OSP 2.0 пропадание штрих-кодов

Вы имеете в виду, что из справочника товаров OLS Pro самопроизвольно пропадают ШК, назначенные товарам?
Раньше мы с такой ситуацией не сталкивались. Если проблема реально существует, то для ее решения весьма желательно знать последовательность действий пользователя, которая приводит к возникновению описанной ситуации.

Я рекомендовал бы перейти на OLS Pro 2.2, поскольку в нем было произведено достаточно количество доработок по отношению к используемой Вами версией 2.0.