Для этого необходимо применить механизм товарных групп, который присутствует в ККМ. Товарные группы программируются на кассе. В Вашем случае необходимо запрограммировать необходимое число ТГ по количеству используемых налогов. При формировании check200.dbf, перед вызовом метода печати чека, в каждой покупке необходимо прописать номер ТГ (поле TOVGR) cоответствующий нужному налогу. Или значение 0, если налога не требуется.